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MagiCoder Pro
MagiCoder Pro è uno strumento che riconosce automaticamente i termini di un determinato dizionario all’interno di un testo a formato libero, come ad esempio (a titolo esemplificativo ma non esaustivo):
- termini MedDRA nelle segnalazioni di reazioni avverse ai farmaci (ICSR);
- termini ICD nelle cartelle cliniche elettroniche (EHR);
- termini IDMP nei Riassunti delle Caratteristiche del Prodotto (RCP).
Nella tabella seguente sono riportati alcuni esempi di output.
| Testo originale | Dizionario fornito | Termini riconosciuti |
|---|---|---|
| “Dopo aver assunto gli antibiotici, il paziente ha manifestato eritema ed edema ai polsi e alle caviglie.” | MedDRA | «10015150 Eritema», «10076565 Edema ai polsi», «10002542 Edema alle caviglie» |
| “Ogni compressa rivestita con film contiene leflunomide.” | IDMP | « 100000085463 Leflunomide», «100000073665 Compressa rivestita con film» |
Tavola 1 – Esempio di output di MagiCoder Pro
MagiCoder Pro supporta più dizionari e diverse lingue.
È inoltre rapido (restituisce i risultati in pochi millisecondi) e altamente affidabile (individua in media fino al 90% dei termini presenti nel testo sorgente, indipendentemente da declinazioni, punteggiatura, refusi, ecc.).
Offre inoltre la possibilità di integrazione con altri software o flussi di lavoro (tramite API) e supporta l’hosting autonomo (tramite Docker).
Infine, può essere utilizzato anche tramite un’estensione per Mozilla Firefox per codificare il testo selezionato su qualsiasi sito web o PDF aperto nel browser.
MagiCoder Pro è disponibile in due versioni:
- la versione “Managed” (gestita) è pensata per chi desidera ridurre l’onere operativo e accedere più rapidamente alle funzionalità del software;
- la versione “Self-hosted” (autogestita) è ideale per chi preferisce mantenere il pieno controllo sul software e dare priorità alla riservatezza.
Nella versione gestita, INSPIRE si occupa dell’esecuzione di MagiCoder Pro, fornendo l’hardware (una macchina virtuale dedicata dimensionata in base alle esigenze dell’utente) e gestendo l’installazione e la configurazione del software con i dizionari preferiti dall’utente.
Nella versione autogestita, la responsabilità dell’esecuzione di MagiCoder Pro è dell’utente. INSPIRE fornisce una versione del software containerizzata (Docker) e alcuni script per avviare (o arrestare) uno o più container su una macchina virtuale dedicata, all’interno dell’infrastruttura dell’utente.
Scopri di più sul sito ufficiale.
Pharmacovigilance Kit
Nella versione attuale, Pharmacovigilance Kit è un’applicazione web il cui obiettivo principale è semplificare la generazione di segnalazioni individuali di sicurezza (ICSR) nel formato attualmente accettato dai sistemi delle autorità regolatorie: lo standard internazionale E2B R3, che definisce le modalità di trasmissione elettronica di tali segnalazioni tra le parti interessate.
Lo strumento non è destinato agli utenti finali, bensì a utenti tecnici che desiderano integrarlo (tramite API) nelle applicazioni e/o nei flussi di lavoro dei dati della propria organizzazione. Ad esempio, è possibile utilizzarlo per convertire facilmente i dati raccolti durante una ricerca o uno studio clinico in ICSR valide per il sistema EudraVigilance dell’EMA. Ciò è possibile perché Pharmacovigilance Kit consente di operare con un modello dati fisico più intuitivo per lo standard E2B R3, passando agevolmente dal formato XML (leggibile solo dalle macchine) al formato JSON (leggibile anche dagli esseri umani).
Nella versione attuale, Pharmacovigilance Kit consente agli utenti di:
- Recuperare tutti i vocabolari controllati relativi allo standard E2B R3 (inclusi quelli ISO IDMP).
- Convertire i rapporti di sicurezza da JSON a XML E2B (R3).
- Convertire i rapporti di sicurezza da XML E2B (R3) a JSON.
- Convertire i rapporti di sicurezza da XML E2B (R3) a HTML.
Nelle versioni future, Pharmacovigilance Kit permetterà inoltre di trasferire direttamente gli ICSR a EudraVigilance e sarà ospitabile in autonomia (self-hosted).
In passato, la libreria principale di Pharmacovigilance Kit è stata utilizzata nel progetto CovidVaccine-Monitor (CVM) per generare ICSR conformi allo standard E2B per EudraVigilance, a partire dai dati raccolti tramite Research Online.
Pharmacovigilance Polaris
Pharmacovigilance Polaris è uno strumento che genera un archivio interrogabile di indicazioni terapeutiche e reazioni avverse ai farmaci riportate nel Riassunto delle Caratteristiche del Prodotto (RCP). All’interno del dataset, tutti i concetti medici sono codificati come LLT (Lowest Level Terms) del MedDRA.
Attualmente, Pharmacovigilance Polaris opera con gli RCP (Riassunti delle Caratteristiche del Prodotto) italiani, scaricando automaticamente quelli pubblicati sul portale dell’AIFA dedicato ai medicinali; tuttavia, su richiesta, il sistema può essere esteso ad altre fonti di dati.
Può essere utilizzato per:
- Analisi dei rapporti di sicurezza: per verificare se una reazione è nota per un determinato farmaco, individuare un uso *off-label* o classificare le coppie farmaco-reazione ai fini del rilevamento di segnali di sicurezza.
- Armonizzazione degli RCP: per individuare incongruenze tra medicinali aventi la stessa composizione farmaceutica.
- Deprescrizione farmacologica: per identificare automaticamente condizioni cliniche trattate con un farmaco che potrebbero, in realtà, essere reazioni avverse a un altro farmaco.
Nelle versioni future, Pharmacovigilance Polaris fornirà anche dati sulle frequenze delle reazioni avverse ai farmaci e supporterà la ricerca basata sulla similarità semantica.
